Příběh .hack//Link se odehrává ve fiktivní verzi roku 2020 v nové verzi „The World“, populární série MMORPG známé jako The World: RX. Hra se zaměřuje na mladíka
Příběh .hack//Link se odehrává ve fiktivní verzi roku 2020 v nové verzi „The World“, populární série MMORPG známé jako The World: RX. Hra se zaměřuje na mladíka jménem Tokio Kurjú, studenta druhého ročníku nižší střední školy, kterého do The World: RX přenese nová studentka Saika Amagi. Po příchodu do hry je Tokio pověřen verzí postavy Kite s umělou inteligencí, aby se stal hrdinou a využil věž Akašických záznamů k záchraně Twilight Knights – skupiny umělých inteligencí založených na postavách z předchozích dílů série .hack. Pomocí Akašických záznamů může Tokio cestovat zpět v čase do předchozích titulů .hack a setkávat se s dřívějšími postavami, aby rozmrazil data Twilight Knights.