Drakengard 3 přenese hráče do středověkého světa, kde šest božských sester známých jako „Intoners“ nastolilo na zemi mír díky své schopnosti ovládat magii prost
Drakengard 3 přenese hráče do středověkého světa, kde šest božských sester známých jako „Intoners“ nastolilo na zemi mír díky své schopnosti ovládat magii prostřednictvím zpěvu. Harmonie je však narušena, když se nejstarší sestra Zero pokusí s pomocí svého dračího společníka Mikhaila zavraždit své mladší sestry. Jak příběh postupuje, hráči se ocitají v bitvě s cílem rozplést tajemství kolem Zero a zjistit její skutečné úmysly. Drakengard 3, coby prequel k původnímu Drakengardu, přináší pro sérii typickou akci, v níž hráči čelí hordám běsů a nepřátel v nelítostných hack-and-slash pozemních soubojích, aby se vzápětí vznesli k nelítostným vzdušným bitvám na hřbetě draka Mikhaila.
Příběh se zaměřuje na Zero, ženu, která dokáže manipulovat s magií prostřednictvím zpěvu. Společně se svým partnerem, drakem jménem Mikhail, se Zero vydává zabít svých pět sester, které vládnou jednotlivým regionům světa. Během její cesty hráč odhaluje skutečný důvod, který za jejím zběsilým tažením stojí.