Tomb Raider prozkoumává intenzivní a syrový příběh původu Lary Croft a její přerod z mladé ženy v neohroženou hrdinku, která přežije i nemožné. Lara, vyzbrojena
Tomb Raider prozkoumává intenzivní a syrový příběh původu Lary Croft a její přerod z mladé ženy v neohroženou hrdinku, která přežije i nemožné. Lara, vyzbrojena pouze instinkty a schopností posouvat hranice lidské vytrvalosti, musí bojovat za rozluštění temné historie zapomenutého ostrova, aby unikla z jeho neúprosného sevření.
Hra začíná v momentě, kdy se Lara vydává na svou první expedici na palubě lodi Endurance s cílem najít ztracené království Yamatai. Na její doporučení a proti radám Whitmana se výprava odváží do Dračího trojúhelníku východně od Japonska. Loď je zasažena prudkou bouří a ztroskotá, přičemž přeživší uvíznou na izolovaném ostrově. Lara je oddělena od ostatních a zajata podivným, divošským mužem. Podaří se jí však uprchnout, zatímco její věznitel umírá v troskách hroutící se jeskyně. Během snahy najít ostatní trosečníky Lara naráží na důkazy, že ostrov je obydlený – nachází podivné řezby, mrtvá těla a zvířecí oběti. Nakonec najde svou přítelkyni Sam a muže jménem Mathias, který o sobě tvrdí, že je učitel, jenž na ostrově rovněž ztroskotal. Zatímco Sam vypráví Mathiasovi legendy o Himiko, Lara omdlí; když se probere, Mathias i Sam jsou pryč. Poté, co se Lara setká s dalšími přeživšími, Whitman se rozhodne pátrat po stále nezvěstném Rothovi s Larou, zatímco zbytek skupiny (Reyes, Jonah, Alex a Grim) se vydává hledat Sam a Mathiase. Během průzkumu Lara s Whitmanem zjistí, že obyvatelé ostrova uctívají Himiko, což potvrzuje, že ostrov je skutečně Yamatai. Po objevení svatyně postavené na počest Himiko jsou zajati ostrovany a odvedeni do osady spolu s několika dalšími přeživšími z Endurance. Když se trosečníci pokusí o útěk, věznitelé na ně zaútočí. Lara se oddělí od Whitmana a snaží se schovat, ale je odhalena jedním z ostrovanů a donucena ho zabít. Odrazí zbytek útočníků a znovu se setká s Rothem, kterého zachrání před útokem vlků. Laře se podaří aktivovat rádiovou věž a přivolat pomoc, ale letadlo, které na volání odpoví, zasáhne podivná bouře a Lara zaslechne záhadný hlas v japonštině říkající: „Nikdo neodejde.“ Lara nedokáže zachránit piloty, ale kontaktují ji Alex a Reyes se zprávou, že Sam byla unesena ostrovany – násilným kultem známým jako Solarii Brotherhood. Lara se ji pokusí zachránit, ale zastaví ji Mathias, vůdce Solarii, a nařídí její popravu; zachrání ji útok Oni, stvoření připomínajících samuraje. Poté, co unikne ze starověkého kláštera, kam ji Oni odvlekli, dozvídá se od Sam, že ji Mathias hodlá podrobit „Nanebevstoupení“ (Ascension). Jde o rituál ohněm k nalezení příští Sluneční královny, který ji v případě neúspěchu upálí zaživa. Lara je sleduje k pevnosti Solarii a pomáhá jí Grim. Kultisté vezmou Grima jako rukojmí, ale ten se obětuje, aby Lara mohla uniknout. S Rothovou pomocí Lara infiltruje pevnost a sleduje začátek rituálu. Když jsou ohně zapáleny, náhlý silný vítr je uhasí, což označí Sam jako příští Sluneční královnu. Lara znovu uniká a setkává se s přáteli, s nimiž plánuje záchranu Sam a útěk z ostrova. S pomocí Whitmana – kterému se podařilo se Solarii vyjednat jistou míru svobody – se Lara vrací do paláce zachránit Sam, zatímco Roth se zmocní helikoptéry k odletu. Lara uspěje, ale když vidí, jak se k blížícímu se vrtulníku stahují další mračna, přesvědčí Sam k útěku po zemi. Lara se pokusí donutit pilota k přistání, ale stroj je sražen k zemi a Lara málem zahyne. Roth ji oživí, ale vzápětí schytá smrtelnou ránu sekerou, kterou Mathias mířil na Laru. Při truchlení pro Rotha Lara přijímá fakt, že bouře nejsou přirozené, ale jsou nějak propojeny se Sluneční královnou a mají za úkol zabránit komukoliv v opuštění ostrova. Setkává se s ostatními trosečníky, kteří se vyhýbali kultu dost dlouho na to, aby zajistili člun, na kterém by mohli uniknout, pokud se ho podaří opravit. Přidá se k nim Whitman, který tvrdí, že utekl, ačkoliv ho Lara začíná podezřívat ze spolupráce s kultisty. Lara a Alex najdou součástky pro člun ve vraku Endurance. Jsou však napadeni Solarii a Alex odpálí nálož, čímž se obětuje, aby Lara mohla uniknout s potřebným nářadím. Lara najde záznamy o japonské armádě z druhé světové války a nacistické vědecké expedici, která hledala způsob, jak využít bouře jako zbraň. Rozhodne se prozkoumat hrobku na pobřeží, kde najde ostatky samurajského generála, který spáchal seppuku. Z jeho vzkazu vyplyne, že velel královnině Stráži bouří (Stormguard), tedy Oni, kteří brání klášter, a že nástupkyně královny si raději vzala život, než aby přijala moc Sluneční královny. Lara si uvědomí, že Nanebevstoupení není korunovace, ale rituál k přenesení duše původní Sluneční královny do nového těla; královna si totiž zajistila nesmrtelnost tím, že svou duši pokaždé přenesla do těla mladé dívky. Sebevražda poslední kněžky rituál přerušila a uvěznila královninu duši v jejím rozkládajícím se starém těle. Himiko od té doby touží z mrtvoly uniknout. Jako potomek Yamatai je Sam vhodnou kandidátkou a Mathias ji plánuje nabídnout jako novou schránku výměnou za svou svobodu. Lara se vrací k přeživším na pláži, ale zjistí, že Whitman je zradil, unesl Sam a předal ji Mathiasovi. Lara, Jonah a Reyes vyrazí pronásledovat únosce k horskému klášteru. Lara dorazí právě včas, aby viděla, jak Mathias obelstí Whitmana – ten se pokusí oslovit Oni, kteří ho okamžitě zabijí. Po probojování se přes Solarii i Stráž bouří se Lara dostane na vrchol kláštera, kde Mathias provádí rituál. Lara si proseká cestu k centrální plošině a po souboji srazí Mathiase z útesu vstříc smrti. Symbolicky k tomu použije dvě pistole (svou a jeho), což se později stane jejím poznávacím znamením. Navzdory Mathiasově smrti rituál pokračuje a duše Himiko začíná proudit do Sam. Lara však zničí starověké ostatky Himiko, čímž zachrání Sam a rozežene bouře. Lara, Sam, Reyes a Jonah opouštějí ostrov a jsou zachráněni nákladní lodí. Během plavby domů si Lara uvědomí, že mýty, které jí vyprávěl otec, nebyly jen pohádky. Rozhodne se, že se domů zatím nevrátí, a obrazovka zbělá s nápisem „Zrodila se hrdinka“ (A Survivor is Born).