Assassin's Creed je nelineární akční adventura, ve které hráč ovládá Altaïra Ibn-La'Ahada, levantského asasína z 12. století působícího v období třetí křížové v
Assassin's Creed je nelineární akční adventura, ve které hráč ovládá Altaïra Ibn-La'Ahada, levantského asasína z 12. století působícího v období třetí křížové výpravy. Jeho život prožívá prostřednictvím zařízení Animus jeho potomek v 21. století, Desmond Miles.
Desmond Miles, barman, je unesen společností Abstergo Industries, aby sloužil jako testovací subjekt v „Animu“ – zařízení, které dokáže simulovat genetickou paměť. Abstergo má v úmyslu Desmonda do přístroje umístit, aby vyvolalo vzpomínky jeho předka jménem Altaïr Ibn-La'Ahad. Ten byl v roce 1191 členem bratrstva asasínů a žil ve Svaté zemi v době třetí křížové výpravy. Desmond má zpočátku potíže se na zařízení adaptovat, ale v průběhu několika příštích dní nakonec Altaïrovy činy znovu prožije. Hra se poté přepne primárně do Altaïrova pohledu s občasnými přechody k Desmondovi, které jsou způsobeny problémy s Animem nebo nástupem efektu prolnutí (Bleeding Effect). Hra začíná Desmondovým vstupem do Altaïrovy vzpomínky, ale brzy čelí problémům se synchronizací. Přitom jsou slyšet hlasy Lucy Stillman a Warrena Vidica, kteří se přou o Desmondovu bezpečnost v Animu. Po několika potížích Desmond virtuální simulaci opustí a Vidic ho informuje o vnitřním fungování Animu, načež spustí výukový program. Jakmile Desmond tutoriál dokončí, vstoupí do nejbližší synchronizovatelné vzpomínky Altaïra. Lucy dodává, že Desmond musí znovu prožít klíčové okamžiky Altaïrova života, aby zvýšil svou synchronizaci, než dosáhne závěrečné vzpomínky obsahující informace, které Abstergo hledá. Altaïr se poprvé objevuje při pokusu o získání jednoho z artefaktů známých jako „Pieces of Eden“ (úlomky Ráje) v Šalomounově chrámu za pomoci Malika Al-Sayfa a jeho bratra Kadara. Zastaví je však Robert de Sablé, velmistr řádu templářů a zapřisáhlý nepřítel asasínů. Během pokusu o získání pokladu Altaïr poruší všechna tři přikázání asasínského kodexu (Assassins' Creed) ve snaze zabít Roberta, ale neuspěje. V následném zmatku je zabit Malikův bratr a Malikova levá ruka je zmrzačena a později amputována. Když se Altaïr s omluvou vrátí do asasínské pevnosti Masyaf, vrací se i Malik, který de Sablého přežil, přináší artefakt a Altaïrem kvůli jeho aroganci opovrhuje. Poté, co asasíni s vypětím všech sil odrazí odvetný útok templářů, Al Mualim, vůdce bratrstva, degraduje Altaïra na učedníka, ale dává mu šanci znovu v hierarchii bratrstva postoupit. Al Mualim pověří Altaïra úkolem zavraždit devět klíčových postav ve Svaté zemi – v Jeruzalémě, Akkonu a Damašku – s cílem nastolit mír mezi křižáckými a saracénskými vojsky. Každý cíl vychází ze skutečné historické postavy z období třetí křížové výpravy, včetně jmen jako Majd Addin, Garnier de Naplouse, Jubair al Hakim, Abu'l Nuqoud, Sibrand, Vilém z Montferratu a Robert de Sablé. Altaïr plní jednotlivé úkoly a dozvídá se, jak je každý cíl propojen s Robertem a templáři a jak společně usilují o ukončení křížových výprav a ovládnutí Svaté země. Zatímco muži na obou stranách umírají, odhaluje Robertovo poslední spiknutí: pokus sjednotit křesťanské a muslimské síly proti jejich novému společnému nepříteli – samotným asasínům. Altaïr poráží de Sablého před Richardem Lví srdce. Přestože se mu nepodaří krále přesvědčit, že konec války by uvítaly obě strany, Robertovo spiknutí ukončí. Od de Sablého se Altaïr dozvídá, že i Al Mualim byl členem templářů a využil jej k odstranění ostatních členů, kteří znali tajemství moci pokladu, aby si mohl artefakt sobecky nechat pro sebe. Altaïr se rychle vrací do Masyafu ke svému mistrovi, který mu odhaluje pravdu: Piece of Eden, který získal s Altaïrovou pomocí těsně před jeho selháním, vytváří iluze. Al Mualim označuje náboženství a další zdánlivě nadpřirozené události (např. deset ran egyptských, rozestoupení Rudého moře či přítomnost řeckých bohů v trojské válce) za iluze způsobené artefaktem. Následně deklaruje svůj záměr použít Piece of Eden k vymytí mozků lidstva, čímž chce ukončit veškeré konflikty. Altaïr je nakonec schopen prohlédnout klamy vytvořené artefaktem a Al Mualima zabije. Když Altaïr artefakt získá, Piece of Eden se aktivuje a zobrazí holografickou mapu světa s vyznačenými polohami dalších úlomků Ráje po celé zeměkouli. Po dokončení procesu se Desmond dozvídá, že Abstergo je moderní zástěrkou templářů a že již pátrají po dalších artefaktech na místech identifikovaných v Altaïrových vzpomínkách. Dále zjišťuje, že se ho moderní asasíni pokusili zachránit ještě před dokončením simulace, ale neuspěli. Desmond má být na příkaz vysoce postaveného templáře Alana Rikkina zabit, ale Lucy Stillman ho zachrání a v jednu chvíli skryje prsteníček do dlaně, čímž odkazuje na asasínskou tradici uřezávání prstu. Ačkoliv Desmond zůstává uvězněn v laboratoři Absterga, jeho pobyt v Animu vyvolal efekt prolnutí (Bleeding Effect), díky němuž se Altaïrův život promítá do jeho vlastního. To Desmondovi umožňuje používat Altaïrův orlí zrak (Eagle Vision), s jehož pomocí vidí podivné zprávy namalované na stěnách svého pokoje a na podlaze laboratoře. Všechny zprávy se týkají různých forem konce světa z pohledu různých kultur, včetně několika odkazů na 21. prosinec 2012 – datum, kdy Abstergo plánuje vypustit satelit, jenž má „navždy ukončit válku“. Je naznačeno, že k tomu dojde stejným způsobem, jakým Al Mualim zhypnotizoval Masyaf, jen ve větším měřítku. Hra končí ve chvíli, kdy Desmond přemýšlí, co všechny ty obrazy znamenají a kdo je mohl nakreslit.